La existencia de Chilches se remonta a la época romana, siendo fundado en el año 201 AC. Con la caída del Imperio Romano y las posteriores invasiones musulmanas, Chilches se convirtió en una villa romano-musulmana constituida por cuatro alquerias.Chilches fue declarada VILLA REAL por Real Pragmática, expedida en Zaragoza el 14 de junio de 1297, y Pragmática en Valencia el 13 de febrero de 1306.
Fecha memorable para la población fue el día 18 de enero de 1625 en la que los hermanos Margalló encontraron en la partida Les Chovaes la figurqa de un Cristo que tenia sus pies sobre una junquera. Esta imagen, conocida como el Santísimo Cristo de la Junquera, es en la actualidad el Patrón de nuestro municipio.
Al terminar la Guerra Civil española y, tras la firma del Decreto de adopción el 9 de marzo de 1940, por la Dirección General de Regiones Devastadas se realizaron obras y mejoras en la urbanización del pueblo.
En la partida de L'Alter se hallaron restos de la antigua vila romana, destacando la estatuilla de Mercurio (Dios Hermes), realizada en bronce y que se encuentra depositada en el Museo Arqueológico Municipal de Burriana.
En la remodelación de la Calle Juan Carlos I, se hallaron restos de una necropolis que data a partir del s. XIII, con seis estelas discoidales que podemos ver en el lugar donde fueron halladas (detrás de la iglesia).
